柳叶刀呼吸医学丨南京医科大学团队利用GWAS多基因评分预测中国人群肺癌风险-肿瘤瞭望

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柳叶刀呼吸医学丨南京医科大学团队利用GWAS多基因评分预测中国人群肺癌风险

作者:肿瘤瞭望日期:2019/7/19 10:43:12 浏览量:17632

导读：2019年7月17日，柳叶刀旗下子刊《柳叶刀呼吸医学》（The Lancet Respiratory Medicine，IF=22.992）在线发表了我国南京医科大学团队的一项研究首次证明，GWAS衍生的多基因风险评分（PRS）可有效地用于鉴别肺癌高危亚群，这些亚群可能受益于基于PRS的中国人群肺癌精确预防筛查方案。

遗传变异在非小细胞肺癌（NSCLC）的发生发展中具有重要作用。然而，肺癌的遗传因素尚未完全确定，特别是在中国人群中，这限制了使用现有的多基因风险评分（polygenic risk scores，PRS）来确定肺癌高危亚群以预防肺癌。因此，本研究旨在鉴定与NSCLC风险相关的新基因座，并产生一个PRS，评估其在中国人群肺癌风险预测中的效用和效力。

为了系统地识别NSCLC风险的基因变异，研究者对南京医科大学全球筛查阵列项目的中国NSCLC病例和对照组中的19 546个样本进行了新的基因分型，并对27 120个NSCLC病例和27 355个没有罹患NSCLC（中国人后裔：13 327个病例和13 328个对照；欧洲人后裔：13 793个病例和14 027例对照）的样本进行了全基因组关联研究的荟萃分析（GWASs）。随后研究者根据所有报道的单核苷酸多态性为中国人群建立了一个PRS，这些多态性在全基因组显著性水平上与肺癌风险相关。研究者进一步在中国嘉道理生物银行（China Kadoorie Biobank，CKB）95 408名患者的独立前瞻性队列中，通过10年以上的随访，评估了该PRS在预测肺癌高风险亚群方面的效用和效力。

该研究确定了19个（p≤5.0×10-8时）与NSCLC风险显著相关的易感性位点，包括6个新的位点。当应用于CKB队列时，相较于低遗传风险参与者（后10%），风险位点的PRS成功地以剂量反应的方式预测了高遗传风险参与者（前10%）的肺癌发病事件（调整后的风险比1.96，95%可信区间1.53-2.51；P趋势=2.02×10−9）。尤其是观察到低、中、高基因风险个体肺癌事件的连续分离曲线，且PRS是年龄和烟龄以外的独立有效风险分层指标。

原文链接：

Juncheng Dai，Prof Jun Lv， Meng Zhu， et al.Identification of risk loci and a polygenic risk score for lung cancer: a large-scale prospective cohort study in Chinese populations.Lancet Respir Med;Published:July 17， 2019DOI:https://doi.org/10.1016/S2213-2600(19)30144-4

版面编辑：洪山责任编辑:彭伟彬

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